A Protokoll egységes szerkezetben, a vonatkozó jogszabályokkal összhangban tárgyalja az iskola- és óvodapszichológusok koordinátorainak feladatait, valamint az iskola- és óvodapszichológusok működésének részletes szabályait.

A protokoll struktúráját tekintve kitér az iskola- és óvodapszichológusok, valamint az őket szakmailag támogató iskola- és óvodapszichológus koordinátorok tevékenységi területére. Rögzíti a nevelési intézményekben dolgozó pszichológusok és a koordinátor elsődleges és másodlagos célcsoportjait, a munka ellátása érdekében szükséges infrastrukturális feltételeket és a jelentkező eszközigényt. Külön szól az iskola- és óvodapszichológusok valamint a koordinátorok szakmai, személyes és szociális kompetenciáiról, valamint egységes keretben mutatja be az iskola- és óvodapszichológusok, és az őket támogató koordinátorok feladatellátási folyamatait. A szakmai és szakmaközi kommunikáció, a szakmai munkát támogató eszköztár és a minőségellenőrzés és adminisztráció kérdései alkotják a protokoll további fejezeteit.